vsftpdの設定でiptablesの設定にでてこずる

CentOSのvsftpdの設定を調べているがiptablesの設定がうまくいかない原因が分からない。
SELinuxの設定は出来た。iptablesを停止させればｆｔｐで通信できる。iptablesを動かすとftpの通信ができない。
gnome-desktopがインストールされている環境でGUIでFTPのポートの通信を許可した場合は動くがgnome-desktopがインストールされていない環境で/sbin/iptablesを使用してルールを追加した場合うまく動かない。
ルールが記述されている順番の問題も考慮し/etc/sysconfig/iptablesを直接編集してもうまくいかない。
GUIで設定してうまく動いている設定と同じ内容にしても動かない。
ip6tablesの設定もしなければいけないのかも。